氣相色譜質(zhì)譜聯(lián)用儀主要通過(guò)色譜分離出復雜基體樣品中的痕量有機小分子目標組分，并通過(guò)三重串聯(lián)四級桿質(zhì)譜進(jìn)行化合物定性及痕量定量分析，并且進(jìn)一步可延伸至痕量多目標組分的快速篩查和結果確證工作。對于氣化或經(jīng)衍生等手段處理后易于氣化的有機物，經(jīng)氣相色譜將各組分分離后，進(jìn)行定性、定量。
氣相色譜質(zhì)譜聯(lián)用儀對羥基、胺基、羧基等進(jìn)行衍生化往往起著(zhù)十分重要的作用。主要有以下一些益處：
?。?）改善了待測物的氣相色譜性質(zhì)。
待測物中一些極性較大的基團的存在，如羥基、羧基等氣相色譜特性不好，在一些通用的色譜柱上不出峰或峰拖尾，衍生化以后，情況改善。
?。?）改善了待測物的熱穩定性。
某些待測物，熱穩定性不夠，在氣化時(shí)或色譜過(guò)程中分解或變化，衍生化以后，待測物定量轉化成在GC-MS測定條件下穩定的化合物。
?。?）改變了待測物的分子質(zhì)量。
衍生化后的待測物絕大多數是分子量增大，有利于使待測物和基質(zhì)分離，降低背景化學(xué)噪音的影響。
?。?）改善了待測物的質(zhì)譜行為。
大多數情況下，衍生化后的待測物產(chǎn)生較有規律、容易解釋的質(zhì)量碎片。
?。?）引入鹵素原子或吸電子基團，使待測物可用化學(xué)電離方法檢測。很多情況下可以提高檢測靈敏度，檢測到待測物的分子量。
?。?）通過(guò)一些特殊的衍生化方法，可以拆分一些很難分離的手性化合物。
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